深澳的历史和整个南澳息息相关。 明万历4年（公元1576年）设“协守漳潮等处专驻南澳副总兵，总镇府（又称总兵府）设深澳镇，翌年副总兵白翰纪到任，在这里建城， 后连续为157任副总兵，总兵府所在地。1912年南澳设立军民府,1913年南澳军民府改为南澳县建制，县城仍然设在这里。自设立副总兵府始，城内以镇府前的贵丁街分解，东属闽诏安县地，由右营所辖；西属粤饶平县地，由左营所辖。清袭明制，直至1914年10月全岛才划归广东省管辖。

明嘉靖四十四年（1565年），诏安人氏吴平聚众为党,“行劫于海滨诸州县”。驻扎深澳镇西北面一临海村子，该村遂称“吴平寨”。据传吴平将劫掠所得金银分装十八坛藏于现“金银岛” 周围，留下谜一般的歌谣：“水涨淹不着，水涸淹三尺”。吴平寨被戚继光、俞大猷联手剿灭后，十八坛金银藏在哪里至今还是一个谜。 wWw.GdStCy.com 潮阳之窗属潮阳本地门户网站，提供潮阳本地资讯，弘扬潮汕民间艺术 wWw.GdStCy.com

总兵府现正规划重建之中，将建成以总兵府为中心的文物旅游区。奇特的人文，沧桑的岁月使深澳镇形成了具总兵府文物特色的古镇。镇址周围有海防要塞猎屿铳城，威镇南疆的雄镇关，校场演武厅，郑芝龙石牌坊,郑成功招兵树，戚继光俞大猷平倭战场，清戍台澎故兵墓园等众多名胜古迹。 wWw.GdStCy.com 潮阳之窗属潮阳本地门户网站，提供潮阳本地资讯，弘扬潮汕民间艺术 wWw.GdStCy.com